Le but de cette journée est de faire le point sur les méthodes de segmentation intégrant de l’a priori géométrique et leurs applications dans le domaine médical. La journée se focalisera sur la segmentation des structures anatomiques au niveau macroscopique.
En imagerie médicale, la segmentation est une étape importante, puisqu’elle conditionne de manière significative la précision de l’analyse quantitative qui peut être effectuée ultérieurement. Les bruits et les artefacts afférents aux divers systèmes d’acquisition, et la variabilité des structures à segmenter rendent ce traitement particulièrement délicat. La prise en compte de l’information anatomique sous la forme d’a priori géométrique est une solution performante pour rendre les méthodes plus précises et plus robustes...
Le déroulement de cette journée s’articulera en deux parties :
Le matin, les exposés dresseront un état de l’art des méthodes de segmentation :
- modèles déformables (surface actives explicites et implicites),
- croissance de région intégrant des critères géométriques ou topologiques de l’info
- segmentations hybrides combinant/alternant approche région et approche contour…
L’après midi sera dédiée à l’expression des besoins des médecins et des biologistes et à des applications spécifiques. Les domaines d’application pourront être variés : cœur, cartilage, vaisseau, os, cerveau, ainsi que les modalités d’imagerie (IRM, US, TEP, X …).
Conformément au mode de fonctionnement du GDR Stic-Santé, la journée sera introduite par des orateurs invités.
Un appel à communication est ouvert concernant les thématiques de la journée.
Les propositions de communication (1 page maximum) sont à adresser aux organisateurs dés que possible et avant le 12 Avril 2007:
e-mails :
chantal.muller@creatis.insa-lyon.fr,
fernandez@sic.sp2mi.univ-poitiers.fr
francoise.peyrin@creatis.insa-lyon.fr,
Yue-Min.Zhu@creatis.insa-lyon.fr.

10h-10h05 Accueil et présentation de la journée

1ère partie : METHODOLOGIE
10h05-10h30 1er invité (méthode):
Christophe ODET, Jean-Loïc ROSE, UMR 5220, Inserm U630, CREATIS LRMN, Lyon
Synthèse générale des méthodes de segmentation intégrant de l’a priori géométrique

10h30-11h 2ème invité (méthode):
Nicolas PASSAT, LSIIT, UMR 7005, ULP - Strasbourg 1
Analyse des structures vasculaires cérébrales obtenues en IRM., Guidage d'approches discrètes par connaissance anatomique.

11h–11h30 Benoît SCHERRER, TIMC IMAG, Grenoble
Intégration d’information anatomiques a priori dans un cadre Markovien : Application aux IRM cérébrales

11h30–12h Julien FLEUREAU1, Mireille Garreau1, Dominique Boulmier{1, 2}, Alfredo Hernandez1, INSERM U642, LTSI, Rennes
Segmentation 3D Multi-objets d’images MSCT cardiaques par une approche multi-agents

12h-12h30 Patrick CLARYSSE, UMR 5220, Inserm U630, CREATIS LRMN, Lyon
Modèle déformable pour la segmentation du  cœur

PAUSE    REPAS

2ème partie : APPLICATIONS MEDICALES

14h-14h30 1er invité (applications):
Yohan PAYAN, GMCAO-TIMC, IMAG, Grenoble
Modélisation des tissus mous et chirurgie assistée par ordinateur

14h30-15h 2ème invité (applications):
Philippe PASTOUREAU, Institut de Recherches Servier.
Segmentation du cartilage et étude de l’ostéoarthrite

PAUSE

15h20-15h45 Olivier ALATA, Samuel BURG, SIC,  Poitiers
Segmentation bayésienne de structures anatomiques en imagerie TEP utilisant un mélange de lois de Poisson et les champs de Markov : constat sur la nécessité de la prise en comte d’informations contextuelles et propositions

15h45-16h10 Marie CHUPIN, CNRS UPR 640, Paris
Segmentation automatique compétitive de l'hippocampe et de l'amygdale à partir d'examens IRM: contrainte par des a priori anatomiques

16h10-16h35 François LECELLIER, Stéphanie JEHAN-BESSON, Jalal FADILI, Gilles AUBERT, Marinette REVENU, E. SALOU, UMR CNRS 6072 et CHU, Caen
Segmentation du myocarde en échographie cardiaque par contours actifs basés région

16h35-17h Olivier NEMPONT, Jamal ATIF(*), Elsa ANGELINI, Isabelle BLOCH, ENST (GET - Télécom Paris) - Département TSI - CNRS UMR 5141 LTCI, (*) Univ. des Antilles et de la Guyane
Combinaison d'informations radiométriques et spatiales pour la segmentation de structures anatomiques par surface minimale